依托自产和公共数据平台的微生物组学数据、代谢组学数据、磁共振影像数据等，开展整合长、短读段测序数据的宏基因组数据分析和算法开发、微生物物种识别与基因功能解析、病毒-细菌相互作用预测、微生物组学与影像/行为/基因组学关联分析算法开发等研究。